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cuCIM (Compute Unified Device Architecture Clara IMage) 是一个开源的加速计算机视觉和图像处理软件库，用于生物医学、地理空间、材料与生命科学以及遥感等用例中的多维图像。

cuCIM 为 N 维图像提供了 GPU 加速的 I/O、计算机视觉和图像处理原语，包括

• 颜色转换

• 曝光

• 特征提取

• 滤波器

• 测量

• 指标

• 形态学

• 配准

• 复原

• 分割

• 变换

cuCIM 支持以下格式

• Aperio ScanScope Virtual Slide (SVS)

• Philips TIFF

• 具有以下压缩方案的通用平铺多分辨率 RGB TIFF 文件

  • 无压缩

  • JPEG

  • JPEG2000

  • Lempel-Ziv-Welch (LZW)

  • Deflate

我们的 API 模仿 scikit-image 进行图像操作，模仿 OpenSlide 进行图像加载。

cuCIM 与以下工作流程兼容

• Albumentations

• cuPY

• 数据加载库 (DALI)

• JFX

• MONAI

• Numba

• NumPy

• PyTorch

• Tensorflow

• Triton

cuCIM 在 Apache-2.0 许可下完全开源，Clara 和 RAPIDS 团队欢迎新的和经验丰富的贡献者、用户和爱好者！您可以通过 Anaconda Conda 或 PyPI 下载 cuCIM。感谢您的鼎力支持！下面，我们提供了一些资源助您入门。

博客

• 使用 cuCIM 加速 Scikit-Image API：在 GPU 上进行 N 维图像处理和 IO

• 使用 NVIDIA Clara™ Deploy 加速数字病理学流程

网络研讨会

• cuCIM：一个 GPU 图像 IO 和处理库

目录

• cuCIM API 参考
  • Clara 子模块
    • CuImage
      • CuImage.associated_image()
      • CuImage.associated_images
      • CuImage.cache()
      • CuImage.channel_names
      • CuImage.close()
      • CuImage.coord_sys
      • CuImage.device
      • CuImage.dims
      • CuImage.direction
      • CuImage.dtype
      • CuImage.is_loaded
      • CuImage.is_trace_enabled
      • CuImage.metadata
      • CuImage.ndim
      • CuImage.origin
      • CuImage.path
      • CuImage.profiler()
      • CuImage.raw_metadata
      • CuImage.read_region()
      • CuImage.resolutions
      • CuImage.save()
      • CuImage.shape
      • CuImage.size()
      • CuImage.spacing()
      • CuImage.spacing_units()
      • CuImage.typestr
    • DLDataType
      • DLDataType.bits
      • DLDataType.code
      • DLDataType.lanes
    • DLDataTypeCode
      • DLDataTypeCode.DLBfloat
      • DLDataTypeCode.DLFloat
      • DLDataTypeCode.DLInt
      • DLDataTypeCode.DLUInt
      • DLDataTypeCode.name
      • DLDataTypeCode.value
    • cache
      • CacheType
      • ImageCache
      • preferred_memory_capacity()
    • filesystem
      • CuFileDriver
      • close()
      • discard_page_cache()
      • open()
      • pread()
      • pwrite()
    • io
      • Device
      • DeviceType
  • 核心子模块
    • color
      • color_jitter()
      • image_to_absorbance()
      • normalize_colors_pca()
      • stain_extraction_pca()
    • expose
    • intensity
      • normalize_data()
      • rand_zoom()
      • scale_intensity_range()
      • zoom()
    • 形态学
      • distance_transform_edt()
    • spatial
      • image_flip()
      • image_rotate_90()
      • rand_image_flip()
      • rand_image_rotate_90()
  • skimage 子模块
    • color
      • combine_stains()
      • convert_colorspace()
      • deltaE_cie76()
      • deltaE_ciede2000()
      • deltaE_ciede94()
      • deltaE_cmc()
      • gray2rgb()
      • gray2rgba()
      • hed2rgb()
      • hsv2rgb()
      • lab2lch()
      • lab2rgb()
      • lab2xyz()
      • label2rgb()
      • lch2lab()
      • luv2rgb()
      • luv2xyz()
      • rgb2gray()
      • rgb2hed()
      • rgb2hsv()
      • rgb2lab()
      • rgb2luv()
      • rgb2rgbcie()
      • rgb2xyz()
      • rgb2ycbcr()
      • rgb2ydbdr()
      • rgb2yiq()
      • rgb2ypbpr()
      • rgb2yuv()
      • rgba2rgb()
      • rgbcie2rgb()
      • separate_stains()
      • xyz2lab()
      • xyz2luv()
      • xyz2rgb()
      • xyz_tristimulus_values()
      • ycbcr2rgb()
      • ydbdr2rgb()
      • yiq2rgb()
      • ypbpr2rgb()
      • yuv2rgb()
    • data
      • binary_blobs()
    • 曝光
      • adjust_gamma()
      • adjust_log()
      • adjust_sigmoid()
      • cumulative_distribution()
      • equalize_adapthist()
      • equalize_hist()
      • histogram()
      • is_low_contrast()
      • match_histograms()
      • rescale_intensity()
    • feature
      • blob_dog()
      • blob_doh()
      • blob_log()
      • canny()
      • corner_foerstner()
      • corner_harris()
      • corner_kitchen_rosenfeld()
      • corner_peaks()
      • corner_shi_tomasi()
      • daisy()
      • hessian_matrix()
      • hessian_matrix_det()
      • hessian_matrix_eigvals()
      • match_descriptors()
      • match_template()
      • multiscale_basic_features()
      • peak_local_max()
      • shape_index()
      • structure_tensor()
      • structure_tensor_eigenvalues()
    • 滤波器
      • LPIFilter2D
      • apply_hysteresis_threshold()
      • butterworth()
      • correlate_sparse()
      • difference_of_gaussians()
      • farid()
      • farid_h()
      • farid_v()
      • filter_forward()
      • filter_inverse()
      • frangi()
      • gabor()
      • gabor_kernel()
      • gaussian()
      • hessian()
      • laplace()
      • median()
      • meijering()
      • prewitt()
      • prewitt_h()
      • prewitt_v()
      • rank_order()
      • roberts()
      • roberts_neg_diag()
      • roberts_pos_diag()
      • sato()
      • scharr()
      • scharr_h()
      • scharr_v()
      • sobel()
      • sobel_h()
      • sobel_v()
      • threshold_isodata()
      • threshold_li()
      • threshold_local()
      • threshold_mean()
      • threshold_minimum()
      • threshold_multiotsu()
      • threshold_niblack()
      • threshold_otsu()
      • threshold_sauvola()
      • threshold_triangle()
      • threshold_yen()
      • try_all_threshold()
      • unsharp_mask()
      • wiener()
      • window()
    • 测量
      • approximate_polygon()
      • block_reduce()
      • blur_effect()
      • centroid()
      • euler_number()
      • inertia_tensor()
      • inertia_tensor_eigvals()
      • intersection_coeff()
      • label()
      • manders_coloc_coeff()
      • manders_overlap_coeff()
      • moments()
      • moments_central()
      • moments_coords()
      • moments_coords_central()
      • moments_hu()
      • moments_normalized()
      • pearson_corr_coeff()
      • perimeter()
      • perimeter_crofton()
      • profile_line()
      • regionprops()
      • regionprops_table()
      • shannon_entropy()
      • subdivide_polygon()
    • 指标
      • adapted_rand_error()
      • contingency_table()
      • mean_squared_error()
      • normalized_mutual_information()
      • normalized_root_mse()
      • peak_signal_noise_ratio()
      • structural_similarity()
      • variation_of_information()
    • 形态学
      • ball()
      • binary_closing()
      • binary_dilation()
      • binary_erosion()
      • binary_opening()
      • black_tophat()
      • closing()
      • convex_hull_image()
      • convex_hull_object()
      • diamond()
      • dilation()
      • disk()
      • erosion()
      • footprint_from_sequence()
      • footprint_rectangle()
      • isotropic_closing()
      • isotropic_dilation()
      • isotropic_erosion()
      • isotropic_opening()
      • medial_axis()
      • octagon()
      • octahedron()
      • opening()
      • reconstruction()
      • remove_small_holes()
      • remove_small_objects()
      • star()
      • thin()
      • white_tophat()
    • 配准
      • optical_flow_ilk()
      • optical_flow_tvl1()
      • phase_cross_correlation()
    • 复原
      • calibrate_denoiser()
      • denoise_invariant()
      • denoise_tv_chambolle()
      • richardson_lucy()
      • unsupervised_wiener()
      • wiener()
    • 分割
      • chan_vese()
      • checkerboard_level_set()
      • clear_border()
      • disk_level_set()
      • expand_labels()
      • find_boundaries()
      • inverse_gaussian_gradient()
      • join_segmentations()
      • mark_boundaries()
      • morphological_chan_vese()
      • morphological_geodesic_active_contour()
      • random_walker()
      • relabel_sequential()
    • transform
      • AffineTransform
      • EssentialMatrixTransform
      • EuclideanTransform
      • FundamentalMatrixTransform
      • PiecewiseAffineTransform
      • PolynomialTransform
      • ProjectiveTransform
      • SimilarityTransform
      • downscale_local_mean()
      • estimate_transform()
      • integral_image()
      • integrate()
      • matrix_transform()
      • pyramid_expand()
      • pyramid_gaussian()
      • pyramid_laplacian()
      • pyramid_reduce()
      • rescale()
      • resize()
      • resize_local_mean()
      • rotate()
      • swirl()
      • warp()
      • warp_coords()
      • warp_polar()
    • util
      • crop()
      • dtype_limits()
      • img_as_bool()
      • img_as_float()
      • img_as_float32()
      • img_as_float64()
      • img_as_int()
      • img_as_ubyte()
      • img_as_uint()
      • invert()
      • map_array()
      • random_noise()
      • view_as_blocks()
      • view_as_windows()
  • 子模块目录
    • skimage
      • 子包
      • 实用函数

索引和表格

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